Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX20Q9UHI6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX20Q9UHI6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms