Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMGXB4Q9UGU5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HMGXB4Q9UGU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms