Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms