Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAE1Q9UBE0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAE1Q9UBE0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAE1Q9UBE0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAE1Q9UBE0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAE1Q9UBE0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms