Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LINC00474Q9P2X8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms