Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD4AQ9P2Q2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD4AQ9P2Q2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms