Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHPF2Q9P2E5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHPF2Q9P2E5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms