Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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