Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GGA3Q9NZ52 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms