Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNK4Q9NYG8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNK4Q9NYG8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms