Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMPD3Q9NY59 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPD3Q9NY59 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms