Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2AIPQ9NXV6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AIPQ9NXV6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms