Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC6A13Q9NSD5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms