Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TM7SF3Q9NS93 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms