Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CABP2Q9NPB3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CABP2Q9NPB3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms