Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB9BQ9NP90 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms