Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMG20AQ9NP66 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms