Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BCAS3Q9H6U6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms