Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLSTN2Q9H4D0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms