Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTIF3Q9H2K0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTIF3Q9H2K0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms