Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIL1Q9H173 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIL1Q9H173 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms