Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFDQ9GZP0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFDQ9GZP0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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