Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCSER1Q9C0I3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCSER1Q9C0I3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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