Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRCC1Q9C099 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.9 ms