Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRIP1Q9BX63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRIP1Q9BX63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms