Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPAP1Q9BWH6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPAP1Q9BWH6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms