Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms