Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms