Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms