Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDFIP1Q9BT67 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms