Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK0

MARVELD1, MARVEL domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD1Q9BSK0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MARVELD1Q9BSK0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms