Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HERPUD2Q9BSE4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HERPUD2Q9BSE4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms