Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC77Q9BR77 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC77Q9BR77 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms