Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLF1Q9BQI6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLF1Q9BQI6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms