Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SH3GL3Q99963 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SH3GL3Q99963 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms