Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYD88Q99836 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYD88Q99836 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms