Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POP1Q99575 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POP1Q99575 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POP1Q99575 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POP1Q99575 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POP1Q99575 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms