Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EYA3Q99504 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms