Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNGAP1Q96PV0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNGAP1Q96PV0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms