Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP3Q96P20 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms