Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAMD11Q96NU1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms