Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms