Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM227BQ96M60 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms