Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALPK3Q96L96 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms