Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD3Q96L08 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD3Q96L08 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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