Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD4Q96KN9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD4Q96KN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms