Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDLIM2Q96JY6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDLIM2Q96JY6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms