Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC10A4Q96EP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC10A4Q96EP9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms