Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO17Q96EF6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms