Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NMD3Q96D46 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMD3Q96D46 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms